Der Bahnhof Manyaques liegt bei PK 9.600 (PK = point kilométrique) der schmalspurigen Bahnlinie von Arles-sur-Tech nach Prats-de-Mollo. An diesem Knotenpunkt teilten sich die Linie in die Strecken in Richtung Saint-Laurent-de-Cerdans und in Richtung Prats-de-Mollo. Am 1. August 1913 wurde er von der Compagnie des chemins de fer des Pyrénées-Orientales (CFPO) in Dienst genommen. Mit der Einstellung des Bahnbetriebs auf der Bahnlinie wurde er am 1. Juni 1937 geschlossen.